Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ankrd40Q5SUE8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms