Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm11487Q5RIS0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm11487Q5RIS0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm11487Q5RIS0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm11487Q5RIS0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm11487Q5RIS0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm11487Q5RIS0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm11487Q5RIS0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm11487Q5RIS0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11487Q5RIS0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms