Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rtp3Q5QGU6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtp3Q5QGU6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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