Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkaa1Q5EG47 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms