Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Nlrc3Q5DU56 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nlrc3Q5DU56 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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