Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afap1l2Q5DTU0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afap1l2Q5DTU0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afap1l2Q5DTU0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afap1l2Q5DTU0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afap1l2Q5DTU0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afap1l2Q5DTU0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afap1l2Q5DTU0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Afap1l2Q5DTU0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afap1l2Q5DTU0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms