Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpkowQ56A08 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpkowQ56A08 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms