Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syne3Q4FZC9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms