Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms