Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Usp48Q3V0C5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Usp48Q3V0C5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Usp48Q3V0C5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp48Q3V0C5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp48Q3V0C5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp48Q3V0C5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp48Q3V0C5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Usp48Q3V0C5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp48Q3V0C5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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