Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm44Q3V089 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm44Q3V089 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms