Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm15477-202ENSMUST00000143945 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm44198-201ENSMUST00000203063 2636 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SvipQ3UZP4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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