Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc160Q3UYG1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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