Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc4Q3UP24 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms