Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms