Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Usp30Q3UN04 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp30Q3UN04 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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