Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms