Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.46■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp19Q3UJD6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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