Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam35aQ3UEN2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms