Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Cops9Q3U898 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms