Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hace1Q3U0D9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms