Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hhla1Q3TYV2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hhla1Q3TYV2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms