Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc136Q3TVA9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms