Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt2Q3TTY5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt2Q3TTY5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms