Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3TTJ4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms