Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms