Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms