Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf541Q0GGX2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf541Q0GGX2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms