Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnnm1Q0GA42 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnnm1Q0GA42 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms