Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Pate4Q09098 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pate4Q09098 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms