Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q08AU9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q08AU9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q08AU9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms