Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnma1Q08460 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnma1Q08460 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms