Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou6f1Q07916 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms