Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col17a1Q07563 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col17a1Q07563 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms