Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntn3Q07409 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms