Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah1bQ06985 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms