Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms