Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prrx2Q06348 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prrx2Q06348 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms