Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms