Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPINDOCQ05AH6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINDOCQ05AH6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms