Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr16c6Q05A13 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms