Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fmn1Q05860 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms