Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox13Q04891 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms