Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox9Q04887 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms