Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cxcr5Q04683 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms