Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnd1Q03719 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnd1Q03719 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms