Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlh1Q02576 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms