Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snai1Q02085 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms