Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gja5Q01231 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms