Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb2Q00977 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjb2Q00977 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms